La villa, hoy ciudad de Peto, fue fundada en 1549 por Francisco de Berreo.
Después de la conquista de Yucatán Peto fue incorporado al régimen de las encomiendas
Juan de Aguilar fue encomendero en 1552.
Pedro Magaña y Pacheco en 1624
Antonio Ayora y Porras en 1680
En 1821 Peto con todo Yucatán se declara independiente de España.
1825: Peto pasó a formar parte del partido de Beneficios Altos, con cabecera en Tihosuco.
1841: El pueblo de Peto fue ascendido a la categoría de Villa.
1847 y 1848: Durante la Guerra de Castas, Peto fue escenario de numerosas confrontaciones entre la población indígena y los habitantes blancos. A principios de 1848, la villa fue sitiada primero y ocupada después por los mayas rebeldes, bajo el mando de Jacinto Pat. Los habitantes criollos se trasladaron a Tekax. En noviembre de ese año fue muerto en la villa de Peto Marcelo Pat, hijo de Jacinto, de un balazo en la espalda. Ante la pérdida de su hijo, el caudillo abandonó la villa, desprotegiéndola; fue entonces, dos días después, recuperada la plaza por tropas gubernamentales.
1849: Desde Peto, los curas José Canuto Vela y Jorge Burgos, lanzan un exhorto a la población maya y a todos los rebeldes para que abandonaran la lucha armada. El exhorto fue desoído y la guerra continuó.
1914: El 28 de abril la Villa de Peto se elevó a la categoría de ciudad por decreto.
1918: Peto se erige en municipio libre.
1930: Peto fue considerado un importante centro recolector de resina de chicozapote y es importante durante el auge chiclero de las primeras décadas del siglo xx.